潮間帶微生物研究
潮間帶生物種類豐富, 從肉眼可見到需要顯微鏡才找得到的各種藻類及無脊椎生物少說上百種. 而這些生物表面還住著一群附生細菌. 從哺乳類腸道與植物根部的研究我們知道這些附生在多細胞生物表面的細菌與宿主間通常有密切的互動, 從健康到營養到防禦都有關係. 但是當把鏡頭轉向潮間帶生物時, 我們其實對這群生物表面的微生物一無所知, 甚至對這些生物的認識都不多.
我們從 2010 開始定期拜訪花蓮的海. 目前進行中的是大型藻類及海葵附生及共生微生物的調查, 並且由藻類表面附生細菌中尋找具有分解多醣類的細菌. 海葵體內有共生藻, 我們也正逐步解開共生藻與附生菌相間的互動關係.
我們從 2010 開始定期拜訪花蓮的海. 目前進行中的是大型藻類及海葵附生及共生微生物的調查, 並且由藻類表面附生細菌中尋找具有分解多醣類的細菌. 海葵體內有共生藻, 我們也正逐步解開共生藻與附生菌相間的互動關係.
海葵上的細菌有什麼好玩的?
動物表面的細菌都有它們自己的故事。
這些年在人類腸道菌群的研究中已經知道腸道細菌裡誰是好人誰是壞人. 也唯有在瞭解這些細菌在腸道生態系裡扮演的功能, 我們才能設法讓好菌變多, 壞菌變少, 或者讓持續變動的菌相維持在對我們有利的組成. 水生動物表面和腸道表面都是利用黏膜與外界接觸, 黏膜上出現的微生物種類, 以及控制菌群組成穩定的因子, 對宿主的健康來說就很重要了.
某些細菌總是可以出現在某種動物的表面。這種現象顯然不是隨機就能發生的. 背後一定有個原因. 第一種可能,這細菌或許是老大,別的細菌敢搶地盤就被老大的武力就地正法. 第二種可能是這細菌利用別人不能用的資源, 或者利用資源的能力沒它好. 第三種可能是它不怕宿主的防禦武器. 所以會打人, 搶得快, 打不死是三種可能的策略.
潮間帶主要的動物之一是包括珊瑚和海葵的刺絲胞動物. 目前我們在海葵上看到的結果是菌相算蠻穩定的, 顯示我們看到的菌種是演化上的優勝者. 海水裡同一群細菌落腳在不同海葵上之後展開戰爭, 最後留下的細菌群聚竟然大不相同. 到底是什麼原因讓每種海葵上面出現不同的細菌, 以及這些優勝者為什麼能脫穎而出, 就是我們關心的一個個小故事了.
在 Zoanthus 屬的海葵上我們分離到了 Ruegeria 屬的細菌. 這群細菌生長的速度很慢, 又不會游動, 很難想像它會在全球各地都有被找到的記錄. 過去文獻裡大部份的記錄都是在海洋動物的身上找到它們, 顯然它們有某種特殊本領. 但是我們又只在一種特定的 Zoanthus 上找到它們, 因此這一屬的細菌在海葵上的分佈, 以及在海葵上是不是個共生菌, 就是我們要努力證實的方向了. 目前全球海洋微生物學家對於在海洋環境裡數量佔優優勢的 Alphaproteobacteria 亞門, 特別是 Roseobacter 類的細菌都很感興趣卻又認識不多. 我們的 Ruegeria 正好可以讓我們有個機會來試著回答這類細菌的生態角色.
這些年在人類腸道菌群的研究中已經知道腸道細菌裡誰是好人誰是壞人. 也唯有在瞭解這些細菌在腸道生態系裡扮演的功能, 我們才能設法讓好菌變多, 壞菌變少, 或者讓持續變動的菌相維持在對我們有利的組成. 水生動物表面和腸道表面都是利用黏膜與外界接觸, 黏膜上出現的微生物種類, 以及控制菌群組成穩定的因子, 對宿主的健康來說就很重要了.
某些細菌總是可以出現在某種動物的表面。這種現象顯然不是隨機就能發生的. 背後一定有個原因. 第一種可能,這細菌或許是老大,別的細菌敢搶地盤就被老大的武力就地正法. 第二種可能是這細菌利用別人不能用的資源, 或者利用資源的能力沒它好. 第三種可能是它不怕宿主的防禦武器. 所以會打人, 搶得快, 打不死是三種可能的策略.
潮間帶主要的動物之一是包括珊瑚和海葵的刺絲胞動物. 目前我們在海葵上看到的結果是菌相算蠻穩定的, 顯示我們看到的菌種是演化上的優勝者. 海水裡同一群細菌落腳在不同海葵上之後展開戰爭, 最後留下的細菌群聚竟然大不相同. 到底是什麼原因讓每種海葵上面出現不同的細菌, 以及這些優勝者為什麼能脫穎而出, 就是我們關心的一個個小故事了.
在 Zoanthus 屬的海葵上我們分離到了 Ruegeria 屬的細菌. 這群細菌生長的速度很慢, 又不會游動, 很難想像它會在全球各地都有被找到的記錄. 過去文獻裡大部份的記錄都是在海洋動物的身上找到它們, 顯然它們有某種特殊本領. 但是我們又只在一種特定的 Zoanthus 上找到它們, 因此這一屬的細菌在海葵上的分佈, 以及在海葵上是不是個共生菌, 就是我們要努力證實的方向了. 目前全球海洋微生物學家對於在海洋環境裡數量佔優優勢的 Alphaproteobacteria 亞門, 特別是 Roseobacter 類的細菌都很感興趣卻又認識不多. 我們的 Ruegeria 正好可以讓我們有個機會來試著回答這類細菌的生態角色.